ま行

マグドリーテ	ラヴァケイブスでマグマから出てくる大きい蛇。以外にプラズマビームにも弱い。
マグマサイコビット	火炎弾を撃って攻撃してくる浮遊小型兵器。
マグマボルドラム	火炎弾を撃って攻撃してくる小型の敵。
マグモール	火炎弾のビームで、曲線を描いて発射される。スパイアが得意とする武器。
マルカラ	SR388の原生生物。体を丸めて攻撃してくる。メトロイドⅡではボムしか効かなかった。
マルテビオラ	惑星ゼーベスの原生生物。近づくと襲ってくる敵。
マザーブレイン	メトロイド、スーパーメトロイドの最終ボス。目が弱点。奴はかつて鳥人族の機械であった。
マリーディア	スーパーメトロイドのパワーボムのある場所。
マッシュルームポッド	闇のトーバス全域に存在。衝撃への耐久は強くありません。
マップステーション	行ってない所もマップとして表示される。
ミサイル	サムスの強力な道具。ビームが効かない場合はミサイルで攻撃しよう。
ミサイルタンク	ミサイル最大所持数が増える。ただし難易度によって増加量が違う。
ミサイルブロック	ミサイルのみ壊れるブロック。
ムーワ	クレイドの所へ行く途中に出会うボス。マグマなどを上昇させたりする。頭が弱点。
メインボイラー室	セクター３に存在する。特に何も無いが、一度訪れる。
メインボイラー制御システム室	メインボイラー室の奥にある。研究員に擬態したXがハッキングをした。
メカクロプス	配管内に存在するドローン。おびき寄せてボムで倒せる。
メガサンドワーム	巨大サンドワーム。頭部の単眼が露出しています。
メカリドリー	ゼロミッションの最後のボス。サイボーグ化したリドリー。腹部が弱点。
メケノバイト	ルミナスが開発したドローン。誘導性エネルギー弾で攻撃してきます。シーカミサイルで両足を攻撃します。
メタ・ヴィプリウムガス	パッファーが体内に所持している猛毒ガス。
メタリドリー	スペースパイレーツが巧妙な技術を使ってリドリーを復活。ミサイルなどの装備もつけ、強くなっている。
メタルハット	ラヴァケイブスに出現。ミサイルのみ効く。
メタルパッファー	パッファーの進化形。ミサイルのみ破壊が可能。破壊すると毒ガスが発生する。
メタルパラサイト	アームキャノンでは全く効果がない。ボムでのみ倒せる。
マッシュルームポッド	闇のトーバス全域に生息可能。衝撃には弱い。
メトロイド	鳥人族が作り出した人工的生物。作った目的はXを抑制するためだった。
メトロイドコクーン	スペースパイレーツがベビーメトロイドを、小動物運搬用に開発された有機体。
メトロイドプライム（スパイダー）	鳥人族が封印させた特別変異したメトロイド。周囲の殻が硬く、弱点が小さい。
メトロイドプライム（ヘッド）	殻を脱いだ第２形体。フェイゾンを自在に操る。フェイゾンビームのみ攻撃が可能。
メーアイ	チョウゾディアにある監視システム。
メーマ	極小生物。バリアスーツを装着しているとダメージを受けなくなる。
メラ	惑星ゼーベスの原生生物。メロに似た性質を持つ敵。動きは鈍い。
メロ	惑星ゼーベスの原生生物。群れで襲ってくる。無視して移動しよう。
モヒーク	おとなしい生物だが、接触すると触覚でダメージを受ける。メトロイドⅡの敵。