| サーダス | アイスバレイのボス。 サーモバイザーで高温の部分を攻撃する。 |
| サーモバイザー | 温度を感知するバイザー。 主に見えない敵に使われる。 |
| サイコビット | 近づくと襲ってくる小型浮遊兵器。 |
| サイドホッパー | ビームでは倒しにくいので、ミサイルで倒す。 色々なタイプがいるようだ。 |
| サイラックス | 銀河連邦とサムスを憎むバウンティーハンター。 究極の力を手にしてサムスを倒そうと決意した。 |
| ザザビー | セクター2のボス。 ジャンプをし続けてサムスをつぶそうとする。 殻は固いが、下のみ柔らかい部分があり、そこを攻撃する。 |
| サップサック | 近づいても何も起こらないが撃つと爆発する。 |
| サムス・アラン | メトロイドゲームの主人公。 バウンティーハンターで賞金稼ぎ。 |
| サンドグラス | 乾燥地帯に生息する植物。 |
| サンドバット | 飛行動物の一種。群れで行動しています。 |
| サンドワーム | 噛みついたり消化液を出して攻撃してくる。通常は地面の中で獲物を待っています。 |
| サンバースト | ライトビームのチャージコンボ。 |
| シーカーミサイル | 一度に何発かミサイルを発射できる能力。 |
| シーゴース | ベビーゴースの強化版。 ビームを背中に吸収する敵だがプラズマビームには滅法に弱い。 ビームを攻撃した後に息ぎれをするのでそこにミサイル攻撃。 |
| シールーク | 空中を行ったり来たりしているメトロイドUの敵。 |
| シールドキー | これを取るとシールドが解除される。 |
| シードバスター | 種子を弾丸として攻撃してくる。群れで行動します。 |
| ジーマ | メトロイドTおよびゼロミッションで初めて出会う敵。 壁にはりついて動き回っている。 |
| ジーラ | ジーマと同じ性質。動きが鈍いが耐久性が優れている。 |
| シクマタジャオ | 小型水棲生物。群れで行動します。 |
| ジャイアントビートル | ターロンビートルの親玉敵存在。 殻が硬く攻撃が効かないが後ろに弱点がある。 |
| シャドウパイレーツ | 薄っすら見える程度でよく把握できない敵。 サーモバイザーかXレイバイザーで対処を。 |
| ジャンプガーディアン | スペースジャンプを持っているウォリアーイング。 大ジャンプをして衝撃波をうってくる。 |
| シャッター | 片方側にいないと空けられないようなスイッチ。 ウェイブビームを所持すると関係なくなる。 |
| ジュディケイター | 冷凍弾のビームで、壁に当たると跳ね返る。 ノクサスが得意とする武器。 |
| シュリークバット | 天井などにつかまって生息する。群れで行動します。 |
| シュリーカー | 獲物が接近すると空中に浮上。ソニック波で攻撃してきます。 |
| シュレッダー | 水面に浮かび、獲物が接近すると空中に浮上。爆発もします。 |
| ショックコイル | 随時ビーム発射可能。 途切れることなく攻撃すると、大ダメージを与えられる。 |
| 審判の門ルミナセウス | 惑星エーテルの一部のエリア。 ブラボー中隊が消息を絶ったエリアでもある。 |
| スーパーミサイル | ミサイルの強化版。 たいていの敵はこれ1発で倒せる。 |
| ズーマ | ターロンオーバーワールド等で地面を這っている敵。 非常に弱く、邪魔にもならないので無視して構わない。 |
| スカラベ | 集団で動き回る敵。 1体1体は弱いが全て食らうとかなりのダメージ。 |
| スキャッターボルテックス | 3本の触手を伸ばしてパイプ状の地形を往復している敵。 ウェイブビームしか効かない。 |
| スキャンバイザー | 色々なものを調べるバイザー。 スイッチ起動にこのバイザーが使用されるときもある。 |
| スポア・スポーン | スーパーメトロイドのボス。比較的弱い。 |
| スクリー | 天井から急降下して攻撃してくる敵。 |
| スペイザー | ショットの範囲が3倍になり威力も倍増するアイテム。 |
| スクリューアタック | サムス唯一の直接攻撃。 破壊力は相当あり、非常に強い。 |
| スクリューアタックブロック | スクリューアタックで壊せるブロック。 |
| スクリューボール | スクリューアタックのアイテム。 スマブラDXではジャンプするだけでスクリューアタックに。 |
| スクイプト | マグマから出てくる。ビームでは倒せないので無視しても良い。 |
| スターシップ | サムスの宇宙移動のさいの乗り物。 セーブ、ミサイル、エネルギーの補給ができる。 ちなみにサムスはゼロミッション、フュージョンで2度壊している。 |
| スティングラーバ | カンデンのトランスフォーム。 芋虫型で、追尾ボムを使う。 |
| ストーントード | 殻が硬く倒せないがモーフボールで飲み込まれたときにボムをして倒せる。 |
| ストライカー | 近づくと突進してくる敵。 比較的弱いのでパワービームで充分。 |
| スネークウィード | 地面から出ている食虫植物。 サムスが歩くと動きが鈍る。 |
| スパイア | ダイアモント族ただ1人の生き残り。 種族滅亡の理由と究極の力を知るべく、 アレンビッククラスターへ向かう。 |
| スパイダーガーディアン | 電磁フィールドを発生して攻撃してくる。 スパイダーボールを持っている。 |
| スパイダーボール | ボールトラックに磁力を使って這いまわれるアイテム。 メトロイドUでは何処でも使用できた。 |
| スパンクバイン | チョウゾルーインズで壁から顔をだしている敵。 ビームで攻撃すると一時的に顔を引っ込めるが倒せない敵。 |
| スピナー | ブーストボールを使うと何らかの変化が起こる装置。 |
| スピードブースター | ずっと走っていると高速で走れるようになる装備。 この状態では無敵になる。 ブーストタックルという技もできる。 |
| スプリッターダークヘッド | スナッチされたスプリッターヘッド。 |
| スプリッターダークレッグ | スナッチされたスプリッターレッグ。 |
| スプリッターヘッド | スプリッターの本体。属性を替えて攻撃をしてくる。 |
| スプリッターレッグ | 四本足のレッグ。ヘッドが無いと作動されません。 |
| スプリンター | 体当たりで攻撃をしてきます。群れで行動します。 |
| スプリンターコクーン | スプリンターのまゆ。衝撃への強度はありません。 |
| スペースパイレーツ | サムスを幾度と苦しめた宇宙海賊。 ビームやカマを装備し、あるパイレーツはそれ以上に強い。 |
| スペースジャンプ | プライムでは2段ジャンプ。 2Dでは無限ジャンプの装備。移動範囲が非常に広がる。 |
| スルーブロック | 上に乗ると壊れるブロック。それ以外では壊れない。 |
| スレンチ | アレンビック族がオクトリスを護るため作られた兵器。 バリアによって本体は護られている。 計4種類存在する。 |
| スポーブ | 獲物が接近すると動き出して、毒液を発して攻撃してきます。 |
| スモア | ジャンプして急降下して攻撃してくる。 底面が弱点。 |
| ゼータメトロイド | 第2回目の脱皮した姿。手や足やしっぽなどが確認でき、攻撃がよりいっそう強くなっている。 |
| セーブステーション | セーブできる場所。所によっては回復できる場所も。 |
| ゼーベス | サムスが育った所でもある。 スーパーメトロイドで爆破されて消滅。 |
| ゼーベス星人 | スペースパイレーツの一つの集団。 こちらはカマではなくハサミのような手をしている。 |
| ゼーベタイト | マザーブレインのいる部屋に複数存在する機械。 再生能力があるので、バリアは一気に壊すこと。 |
| セクター1 [SRX] | 惑星SR388を再現した区域。 |
| セクター2 [TRO] | 熱帯の生態系を研究する区域。 |
| セクター3 [PYR] | 高温地帯の生態系を研究する区域。 |
| セクター4 [AQA] | 水中の生態系を研究する区域。 |
| セクター5 [ARC] | 低温地帯の生態系を研究する区域。 |
| セクター6 [NOC] | 暗闇の生態系を研究する区域。 |
| セプトー | メトロイドUの敵で空中に浮いている。接触してもダメージを受けず、上に乗ることができる。 |
| ゼブ | パイプから無限に出てくる敵。 |
| ゼボ | パイプから無限に出てくる敵。 |
| セレスステーション | アレンビッククラスターの記録が保存されている宇宙基地。 多くの装置が停止している。 |
| セントリアイ | ダークエーテルでの拠点を守備するために開発。 しかしイングにほとんどを奪われました。 |
| ソーバ | ジーマの強化版。耐久力が高い他は変わらない。 |
| ソニックブーム | アナイアレイターのチャージコンボ。 ライト、ダークアモを30、ミサイルを5発消費する。 |
| ゾンビ研究員 | Xに寄生されてやられた研究員。 簡単に倒せるがXがある限り無限に復活する。 |